醫院藥品流通屬物流的配送環節，是指藥品在醫院內的物流活動。醫院藥品供應管理是藥品物流的終端環節，是藥品物流鏈的重要組成部分。物流學追求的是物品流動的低成本、高效率，藥品價格直接影響醫療成本和經濟效益，是確定藥品供應梯次、管理檔次和儲備限量的重要因素。在正常醫療工作中，臨床用藥多數是分梯次進行的，藥品供應也應分梯次進行。
　　
一線藥：即作為一線供應的品種。確定條件是：1.必須是治療中的首選藥。2.首選藥中價格比較低的藥品。3.市場貨源比較充足的藥品。這類藥品應當充分保障。
　　
二線藥：即作為二線供應的品種。確定條件是：1.價格較貴的藥品。2.貨源比較緊張的藥品。3.治療中的次選藥品。這類藥品應當重點保障，計劃供應。
　　
三線藥：即作為三線供應的品種。確定條件是：1.價格昂貴的藥品。2.市場奇缺的藥品。3.治療中的備用藥品。這類藥品供應上必須嚴格控制，主要保障疑難病、特殊病患者以及危重癥患者使用。
　　
以北京軍區總醫院藥劑科為例：自上世紀90年代開始，北京軍區總醫院規定院級庫一線藥高限2個月量，二線藥高限1個月量，三線藥高限0.5個月量，低限都是7天量；各調劑室一線藥高限1個月量，二三線藥高限都為0.5個月量，低限都為7天量。藥庫每周批采購進貨1次，臨時采購急救用藥3小時必須有結果，慢性病用藥1天內必須有結果。沒按時完成記采購失誤1次；每周藥庫給各調劑室大發藥1次，零星補藥1次，1次1種缺貨記責任1次。調劑室1次處方調配缺藥記斷藥1次。該科主任藥師趙漢臣說，十余年來，由于管理界限清楚，忙亂現象大大減少，工作效率明顯提高。藥品采購供應及時率在99％以上，藥品總庫賬物相符率始終保持100％。到2004年藥品消耗達到1.5億元，藥品采購供應組則僅有6人。
　　
藥品儲備（貯存）是為了更好地保證供應，它是藥品物流的關鍵環節，直接影響著醫院藥品供應的效率，關系著臨床療效，因此藥品儲備必須科學合理。趙漢臣認為，合理的儲備應該注意以下幾點：第一，儲備要保障消耗，消耗指導儲備。根據不同時期內消耗量的變化適當調整儲備量，以防斷貨的同時減少占用資金。第二，藥品價格低，占用資金相對少，儲備量可以大一些；藥品價格高，占用資金相對多，儲備量應當少一些。第三，一線藥是必須保障的藥品，應當多儲備；二三線藥可適當少儲備。第四，從物流學角度出發，儲存成本和采購成本是一個問題的兩個方面。儲備量大，采購批量就大，采購次數就少，既可提高工作效率，又可降低采購成本，但庫存成本高；儲備量小，采購量小，采購批量也小，采購次數就多，庫存成本低，采購成本高。事實上，藥品儲備中高效率、快周轉、低成本、高效益，四者是需要一同權衡的。
　　
臨床一線藥品約為品種總數的70％，約占消耗總金額的30％；二線藥約為品種總數的20％，約占消耗總金額的20％；三線藥品約為品種總數的10％，約占消耗總金額的50％。趙漢臣建議，一線藥品種多，但占用資金少，多儲備一些對資金周轉影響不大，但可減少采購次數，既節約采購費用，又有利于提高工作效率。二三線藥，特別是三線藥品種雖少，但占用經費多，應當減少庫存，加快資金周轉。一線藥多儲，二線藥適中，三線藥少儲、勤購。