山東省千佛山醫(yī)院把重點學(xué)科建設(shè)作為醫(yī)院發(fā)展重點，逐步形成了自己的獨(dú)特優(yōu)勢，吸引了廣大的就醫(yī)患者；同時為醫(yī)院的整體發(fā)展和綜合實力的提高注入強(qiáng)大活力。

該院以突出特色醫(yī)療、建設(shè)重點學(xué)科為醫(yī)院發(fā)展的根本，在器官移植、腔鏡手術(shù)、微創(chuàng)手術(shù)、介入治療及心血管內(nèi)科、中醫(yī)科等重點學(xué)科的建設(shè)上不斷加大投入，取得了可喜的成績，也帶動了醫(yī)院整體水平的快速提高。

2002年5月，該院設(shè)立了肝臟移植專業(yè)科室，成立“東方器官移植研究所山東肝移植中心”，目前已成功完成肝臟移植48例，包括老年肝臟移植，減體積肝臟移植等各種類型的移植，其中4例實現(xiàn)術(shù)中術(shù)后零輸血，達(dá)到國內(nèi)領(lǐng)先水平。從上世紀(jì)90年代初，該院開展腎臟移植工作，現(xiàn)已累計完成腎臟移植手術(shù)近400例，醫(yī)院還成功完成了心臟移植手術(shù)10例，并開創(chuàng)了山東肺移植成功的先例，創(chuàng)造了亞洲接受單肺移植術(shù)的年齡最大患者記錄。

該院的微創(chuàng)技術(shù)日臻成熟，已逐步成為常規(guī)手術(shù)，并進(jìn)一步拓寬了應(yīng)用范圍。醫(yī)院引進(jìn)腹腔鏡設(shè)備，成功實施了腹腔鏡結(jié)腸癌手術(shù)、三鏡法治療復(fù)雜的膽石癥等高難度微創(chuàng)外科手術(shù)。醫(yī)院利用陰道鏡、宮腔鏡、十二指腸鏡、膽道鏡等開展多項微創(chuàng)手術(shù)，也均處于山東省內(nèi)領(lǐng)先或先進(jìn)水平。介入治療是醫(yī)院另一個技術(shù)品牌。醫(yī)院對冠狀動脈性疾病進(jìn)行定性、定量診斷研究，大力開展心血管疾病的介入診斷和治療，總體水平居全國先進(jìn)行列。

該院的中醫(yī)中風(fēng)病科在中西醫(yī)結(jié)合治療各種腦病方面獨(dú)樹一幟。主要在運(yùn)用科室經(jīng)驗方面的基礎(chǔ)上結(jié)合中西醫(yī)綜合康復(fù)療法治療中風(fēng)病、中風(fēng)后遺癥、腦動脈硬化、腦萎縮、血管性癡呆、高血壓病、失眠等疾病療效顯著。該院還引進(jìn)了由海南天光高科研制的高能生物離子多功能治療儀，這是一種符合傳統(tǒng)中醫(yī)辨證理論、運(yùn)用生物電生理及生物組織電導(dǎo)基本均衡原理的新型高能物理離子輸入設(shè)備，可深入到達(dá)顱腦和多種臟器病變部位，迅速充分改善病變部位的血供和代謝環(huán)境，該項技術(shù)成果已被納入中國中醫(yī)藥科技開發(fā)交流中心的科技成果重點推廣項目，對中風(fēng)后遺癥的康復(fù)治療中具有獨(dú)特的療效，無疼痛、無損傷、無副作用。